WWW.KN.LIB-I.RU
БЕСПЛАТНАЯ  ИНТЕРНЕТ  БИБЛИОТЕКА - Различные ресурсы
 

«Рабочая программа дисциплины БОЛЬШОЙ ПРАКТИКУМ Направление подготовки 06.04.01 Биология Направленность (профиль) подготовки «Генетика человека» Уровень ...»

МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

«Кемеровский государственный университет»

Институт биологии, экологии и природных ресурсов

Рабочая программа дисциплины

БОЛЬШОЙ ПРАКТИКУМ

Направление подготовки

06.04.01 Биология

Направленность (профиль) подготовки

«Генетика человека»

Уровень образования

уровень магистратуры

Программа подготовки

академическая магистратура

Квалификация магистр Форма обучения очная Кемерово 2017 Оглавление

1. Перечень планируемых результатов обучения по дисциплине соотнесенных с планируемыми результатами освоения образовательной программы 06.04.01 Биология

2. Место дисциплины в структуре ОПОП магистратуры

3. Объем дисциплины в зачетных единицах с указанием количества академических часов, выделенных на контактную работу обучающихся с преподавателем (по видам занятий) и на самостоятельную работу обучающихся

3.1. Объём дисциплины по видам учебных занятий (в часах)

4. Содержание дисциплины, структурированное по темам (разделам) с указанием отведенного на них количества академических часов и видов учебных занятий

4.1. Разделы дисциплины и трудоемкость по видам учебных занятий

(в академических часах)

4.2 Содержание дисциплины, структурированное по темам (разделам)



5. Перечень учебно-методического обеспечения для самостоятельной работы обучающихся по дисциплине..8

6. Фонд оценочных средств для проведения промежуточной аттестации обучающихся по дисциплине...........8

6.1. Паспорт фонда оценочных средств по дисциплине

6.2. Типовые контрольные задания или иные материалы

6.2.2. Наименование оценочного средства

6.2.2.1. Отчет о лабораторной работе

6.3. Методические материалы, определяющие процедуры оценивания знаний, умений, навыков и (или) опыта деятельности, характеризующие этапы формирования компетенций

7. Перечень основной и дополнительной учебной литературы, необходимой для освоения дисциплины.......12

8. Перечень ресурсов информационно-телекоммуникационной сети «Интернет» (далее - сеть «Интернет»), необходимых для освоения дисциплины

9. Методические указания для обучающихся по освоению дисциплины

10. Перечень информационных технологий, используемых при осуществлении образовательного процесса по дисциплине, включая перечень программного обеспечения и информационных справочных систем (при необходимости)

11. Описание материально-технической базы, необходимой для осуществления образовательного процесса по дисциплине

12. Иные сведения и (или) материалы

12.1. Особенности реализации дисциплины для инвалидов и лиц с ограниченными возможностями здоровья

12.2. Перечень образовательных технологий, используемых при осуществлении образовательного процесса по дисциплине

1. Перечень планируемых результатов обучения по дисциплине соотнесенных с планируемыми результатами освоения образовательной программы 06.04.01 Биология

–  –  –

2. Место дисциплины в структуре ОПОП магистратуры Данная дисциплина относится к вариативной части блока «Дисциплины». Требованиями к входным знаниям для освоения дисциплины «Большой практикум» является знание основ генетики, биохимии, цитологии.





Логически дисциплина «Большой практикум» связана с дисциплинами вариативной части профессионального цикла направленности (профиля) Генетика человека - «Структурная геномика», «Функциональная и сравнительная геномика», «Экологическая и информационная геномика» и др.

Освоение дисциплины направлено на подготовку обучающегося к решению следующих задач:

Научно-исследовательская деятельность:

организация и проведение научного исследования по актуальной проблеме в соответствии с направленностью (профилем) программы магистратуры;

формулировка новых задач, возникающих в ходе исследования;

освоение новых методов исследования;

обработка и критическая оценка результатов исследования.

Дисциплина «Большой практикум» изучается на 1 курсе в 2 семестре и на 2 курсе в 3 семестре.

3. Объем дисциплины в зачетных единицах с указанием количества академических часов, выделенных на контактную работу обучающихся с преподавателем (по видам занятий) и на самостоятельную работу обучающихся Общая трудоемкость дисциплины составляет 5 зачетных единиц (з.е.), 180 академических часов.

–  –  –

4. Содержание дисциплины, структурированное по темам (разделам) с указанием отведенного на них количества академических часов и видов учебных занятий

–  –  –

Номер раздела Темы лабораторных занятий дисциплины 1 Лабораторная работа: Выделение ДНК из лейкоцитов крови и буккального эпителия Лабораторная работа: Учет результатов генотипирования образцов ДНК методами электрофореза Лабораторная работа: Измерение концентрации ДНК 2 Лабораторная работа: Пробоподготовка, получение сухих образцов Лабораторная работа: Выявление микроделеций в Y-хромосоме человека методом ПЦР.

Лабораторная работа: Выявление патогенных микроорганизмов ротовой полости человека с помощью ДНК-диагностики.

Номер раздела Темы лабораторных занятий дисциплины 3 Лабораторная работа: Выделение и учет плазмидной ДНК E.coli.

Лабораторная работа: Получение компетентных клеток E.coli. и их модификация методами генной инженерии Лабораторная работа: Выделение одноцепочечных антител после экспрессии в E.coli.

4 Лабораторная работа: Методики культивирования клеток и подготовки препаратов хромосом Лабораторная работа: Модификации процесса культивирования клеток Лабораторная работа: Фиксация культур и подготовка препаратов Лабораторная работа: Анализ препаратов хромосом. Автоматическое и мануальное кариотипирование.

5 Лабораторная работа: Аффинная хроматография иммуноглобулинов сыворотки крови человека Лабораторная работа: Иммуноэлектрофорез по Грабар и Уильямс белков иммуноглобулинов А и G.

Лабораторная работа: Прямой твердофазный ИФА

5. Перечень учебно-методического обеспечения для самостоятельной работы обучающихся по дисциплине

1. Нефедова, Л.Н. Применение молекулярных методов исследования в генетике: учебное пособие для вузов / Л. Н. Нефедова. - Москва: ИНФРА-М, 2013. - 103 с.

6. Фонд оценочных средств для проведения промежуточной аттестации обучающихся по дисциплине (Перечень компетенций с указанием этапов их формирования; описание показателей и критериев оценивания компетенций на различных этапах их формирования, описание шкал оценивания; типовые контрольные задания или иные материалы, необходимые для оценки знаний, умений, навыков и (или) опыта деятельности, характеризующих этапы формирования компетенций в процессе освоения образовательной программы;

методические материалы, определяющие процедуры оценивания знаний, умений, навыков и (или) опыта деятельности, характеризующих этапы формирования компетенций)

6.1. Паспорт фонда оценочных средств по дисциплине

–  –  –

6.2.1. Зачет Зачет по дисциплине выставляется на основании балльно-рейтинговой системы.

При выставлении баллов учитываются следующие критерии:

1 курс, 2 семестр

- посещение лабораторных занятий – 1 балл за занятие (0-6 баллов);

- отчет о выполнении лабораторной работы – 5 баллов за задание (0-30 баллов);

- выполнение практико-ориентированного задания – 5 баллов за задание (0-10 баллов).

Максимальный балл - 46 50-100% – зачтено;

менее 50% – не зачтено 2 курс, 3 семестр

- посещение лабораторных занятий – 1 балл за занятие (0-9 баллов);

- отчет о выполнении лабораторной работы – 5 баллов за задание (0-45 баллов);

- выполнение практико-ориентированного задания – 5 баллов за задание (0-15 баллов).

Максимальный балл - 69 50-100% – зачтено;

менее 50% – не зачтено В том случае, если обучающийся не удовлетворен оценкой, выставленной по результатам балльно-рейтинговой системы, ему предоставляется возможность повысить свой балл:

а) Примерный список практико-ориентированных заданий:

На основании проведенной работы установите преимущества и ограничения мультипраймерного формата ПЦР. Предложите рекомендации для предотвращения появления артефактов при работе.

б) критерии оценивания компетенций (результатов)

- использование научной терминологии;

- правильность решения задачи (проблемной ситуации).

в) описание шкалы оценивания

- оценивание проводится по бальной системе в диапазоне от «0» до «5» баллов.

Критерии оценки:

использование научной терминологии (0-1 балл);

правильность выполнения задания или решения задачи (проблемной ситуации) (0-4 балла);

6.2.2. Наименование оценочного средства 6.2.2.1. Отчет о лабораторной работе

а) Темы лабораторных работ

–  –  –

Раздел 2. Выполнить лабораторную работу «Выявление микроделеций в Y-хромосоме человека методом ПЦР» согласно инструкциям по работе с наборами реагентов (http://www.

lytech.ru/)

Оформить отчет по следующей схеме:

1. Название лабораторной работы

2. Оборудование и реактивы

3. Ход работы

4. Результаты генотипирования образцов ДНК в форме таблицы Выводы Раздел 3. Выполнить лабораторную работу: «Выделение плазмидной ДНК из E.coli»

согласно методическим указаниям (Маниатис Т. и др. Методы генетической инженерии.

Молекулярное клонирование. 1984)

Оформить отчет по следующей схеме:

1. Название лабораторной работы.

2. Оборудование и реактивы.

3. Ход работы.

4. Результаты выделенной ДНК в виде фотографии.

5. Выводы.

б) критерии оценивания компетенций (результатов)

- правильность выполнения задания;

- правильность оформления отчета.

в) описание шкалы оценивания

- оценивание проводится по бальной системе в диапазоне о т «0» до «5» баллов.

Критерии оценки:

правильность выполнения задания (0-4 баллов) правильность оформления отчета (0-1 баллов).

В том случае, если какой-либо из критериев не выполнен или выполнен частично суммарный балл снижается.

6.2.2.2. Практико-ориентированное задание (задача, проблемная ситуация)

а) Описание практических заданий

Примерные материалы:

Раздел 2. На основании проведенной работы установите преимущества и ограничения мультипраймерного формата ПЦР.

Предложите рекомендации для предотвращения появления артефактов при работе.

Раздел 3. Решение генетических задач.

Молекулярная генетика прокариот.

Ваш друг попросил Вас секвенировать два гена бактерий, один из которых кодирует ДНКсвязывающий регуляторный белок, а другой - протеазу, активную в кислой среде. При этом он сказал Вам, что одна из бактерий - мезофильный почвенный микроорганизм, а другая термофил из горячего источника, однако забыл подписать пробирки с образцами, переданными на секвенирование.

У Вас получились следующие последовательности:

1.1... ААТ ГАА АГТ ГАА АТГ ГАТ ТГТ ГЦТ...

1.2... ГЦГ ЦГГ ГГГ АГГ ГГЦ ГЦЦ ААГ ЦЦГ...

Приведены два фрагмента кодирующих цепей, для удобства разбитые на кодоны, табличка генетического кода напечатана внизу страницы (У в иРНК соответствует Т в кодирующей цепи ДНК).

1А) Переведите последовательности нуклеотидов 1.1 и 1.2 в последовательности аминокислот.

1Б) Какая последовательность, вероятно, принадлежит термофильной бактерии и почему?

1В) Какая последовательность, вероятно, кодирует ДНК-связывающий белок, и почему?

1Г) Какая последовательность, вероятно, кодирует кислую протеазу и почему?

б) критерии оценивания компетенций (результатов)

- проработанность доказательной базы;

- использование научной терминологии;

- логичность умозрительных построений.

в) описание шкалы оценивания

- оценивание проводится по бальной системе в диапазоне от «0» до «5» баллов.

Критерии оценки:

проработанность доказательной базы (0-3 баллов) уровень раскрытия темы (0-2 баллов), владение терминологией (0-1 балла).

6.3. Методические материалы, определяющие процедуры оценивания знаний, умений, навыков и (или) опыта деятельности, характеризующие этапы формирования компетенций Процедура оценивания знаний, умений, навыков по дисциплине «Большой практикум»

включает учет успешности по всем видам оценочных средств (п.6.1).

Практические и практико-ориентированные задания направлены на создание условий, при которых обучающиеся пользуются преимущественно репродуктивными методами, наблюдая за изучаемыми объектами, выполняя практические работы по инструкции. Это позволяет сформировать умение анализировать и решать профессиональные задачи разной направленности.

Предлагаемые проблемные ситуации (темы для работы в группе) предназначены для развития навыков по формированию и отстаиванию собственной позиции, умению вести диалог и работать в команде.

Предлагаемые задачи позволяют оценить и диагностировать умения синтезировать, анализировать, обобщать фактический материал с формулированием конкретных выводов, установлением причинно-следственных связей.

7. Перечень основной и дополнительной учебной литературы, необходимой для освоения дисциплины

Основная литература:

1. Теоретические основы и практическое применение методов иммуногистохимии :

руководство / под ред. Д.Э. Коржевский. - 2-е изд., испр. и доп. - СПб. : СпецЛит, 2014. с. : табл., ил. - Библиогр. в кн. - ISBN 978-5-299-00596-7 ; То же [Электронный ресурс]. - URL: //biblioclub.ru/index.php?page=book&id=253816 (28.10.2016).

2. Давыдова, О. Методы генетических исследований микроорганизмов : учебное пособие / О. Давыдова ; Министерство образования и науки Российской Федерации, Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Оренбургский государственный университет». - Оренбург : ОГУ, 2013. с.; То же [Электронный ресурс]. - URL:

//biblioclub.ru/index.php?page=book&id=259161 (28.10.2016).

3. Геномная нестабильность и нарушение репарации ДНК как факторы наследственной и соматической патологии человека : монография / Р.И. Гончарова, Т.Д. Кужир, Н.В.

Савина, Н.В. Никитченко ; Белорусское общество генетиков и селекционеров, Национальная академия наук Беларуси, Институт генетики и цитологии ; под общ. ред.

Р.И. Гончаровой. - Минск : Беларуская навука, 2015. - 283 с. : табл., граф., ил. Библиогр. в кн. - ISBN 978-985-08-1859-1 ; То же [Электронный ресурс]. - URL:

//biblioclub.ru/index.php?page=book&id=436803 (28.10.2016).

4. NGS: высокопроизводительное секвенирование / Д.В. Ребриков, Д.О. Коростин, Е.С.

Шубина, В.В. Ильинский ; под ред. Д.В. Ребриков. - 2-е изд. (эл.). - М. : БИНОМ.

Лаборатория знаний, 2015. - схем., ил., табл.. - 235 с. : ил. - Библиогр. в кн. - ISBN 978-5То же [Электронный ресурс]. - URL:

//biblioclub.ru/index.php?page=book&id=363366 (28.10.2016).

5. Ребриков, Д.В. ПЦР в реальном времени. [Электронный ресурс] / Д.В. Ребриков, Г.А.

Саматов, Д.Ю. Трофимов, П.А. Семёнов. — Электрон. дан. — М. : Издательство "Лаборатория знаний", 2015. — 226 с. — Режим доступа: http://e.lanbook.com/book/70781 — Загл. с экрана.

Дополнительная литература:

1. Практикум по молекулярной биологии [Текст] : учебное пособие для вузов / [А. С.

Коничев [и др.] ; ред. А. С. Максимова. - Москва : КолосС, 2012. - 151 с.

2. Уилсон К. Принципы и методы биохимии и молекулярной биологии [Электронный ресурс] : / Уилсон К., Уолкер Дж. — Электрон. дан. — М. : "Лаборатория знаний" (ранее "БИНОМ. Лаборатория знаний"), 2013. — 859 с. — Режим доступа:

http://e.lanbook.com/books/element.php?pl1_id=8704

3. Цыганский, Р.А. Физиология и патология животной клетки [Электронный ресурс] :

учебное пособие. — Электрон. дан. — СПб. : Лань, 2009. — 333 с. — Режим доступа:

http://e.lanbook.com/books/element.php?pl1_id=431

8. Перечень ресурсов информационно-телекоммуникационной сети «Интернет» (далее

- сеть «Интернет»), необходимых для освоения дисциплины http//www.molbiol.ru http://www.lytech.ru/data/file/dnk3.pdf http://www.lytech.ru/data/file/dnk50.pdf http://www.lytech.ru/data/file/manual-azf-forez-2014-02-10.pdf

9. Методические указания для обучающихся по освоению дисциплины Вид учебных Организация деятельности студента занятий Лабораторная Методические указания по подготовке к лабораторным работам по работа дисциплине размещены в разделе учебно-методические материалы на сайте кафедры генетики КемГУ – genetics.kemsu.ru Рекомендации по подготовке к лабораторным работам: ознакомьтесь с рекомендациями по подготовке к занятию; используя рекомендованные учебные пособия и методические указания лекций подготовьтесь к собеседованию по ключевым вопросам и к выполнению лабораторных заданий Решение задач и Рекомендации по решению задач: внимательно прочитайте условие проблемных задачи; при решении задачи используйте подходы, рассмотренные на ситуаций занятии – стройте генеалогические древа, используйте формулы, (работа в группах составляйте схемы; формулируя ответ, подкрепляйте его теоретическими выкладками Рекомендации по решению проблемных ситуаций: внимательно прочитайте условие задачи; продумайте возможные варианты решения проблемных ситуаций и используйте их на занятии Самостоятельная Включает освоение ряда вопросов по дисциплине, выделенных для работа самостоятельного изучения. Для этого необходимо использовать источники информации из списка литературы, рекомендованной для самостоятельного изучения. Используя материалы лекций-презентации и конспектов лекций и рекомендованных учебных пособий, выполните в рабочих тетрадях задания для самостоятельной работы, подготовьтесь к выполнению аудиторных заданий;

10. Перечень информационных технологий, используемых при осуществлении образовательного процесса по дисциплине, включая перечень программного обеспечения и информационных справочных систем (при необходимости)

1. Использование слайд-презентаций при проведении занятий

2. Организация взаимодействия с обучающимися посредством Интернет-пространства (размещение заданий и рекомендаций для подготовки к занятиям).

11. Описание материально-технической базы, необходимой для осуществления образовательного процесса по дисциплине

Минимально необходимый для реализации дисциплины перечень материальнотехнического обеспечения включает в себя:

а) учебная комната на 15 посадочных мест с ноутбуком, проектором и экраном;

б) ПЦР-лаборатория с комплектом оборудования для проведения генотипирования с электрофоретической схемой детекцией результата;

в) цитогенетическая лаборатория с комплектом оборудования для проведения культивирования клеток, фиксации и кариотипирования.

12. Иные сведения и (или) материалы

12.1. Особенности реализации дисциплины для инвалидов и лиц с ограниченными возможностями здоровья Для осуществления процедур текущего контроля успеваемости и промежуточной аттестации обучающихся инвалидов и лиц с ограниченными возможностями здоровья устанавливаются адаптированные формы проведения с учетом индивидуальных психофизиологических особенностей: для лиц с нарушением слуха – оценочные средства предоставляются в письменной форме с возможностью замены устного ответа на письменный, для лиц с нарушением опорно-двигательного аппарата двигательные формы оценочных средств заменяются на письменные/устные с исключением двигательной активности. При необходимости студенту-инвалиду предоставляется дополнительное время для выполнения задания. При выполнении заданий для всех групп лиц с ограниченными возможностями здоровья допускается присутствие индивидуального помощника-сопровождающего для оказания технической помощи в оформлении результатов проверки сформированности компетенций.

12.2. Перечень образовательных технологий, используемых при осуществлении образовательного процесса по дисциплине Традиционные технологии (лабораторные занятия) Создание условий, при которых обучающиеся пользуются преимущественно репродуктивными методами при работе с конспектами, учебными пособиями, выполняя лабораторные работы по инструкции.

Практико-ориентированная деятельность.

Обучающиеся получают практико-ориентированные задания, которые выполняют сначала в парах, а затем совместно со всей группой и преподавателем. Цель – решения учебных и профессионально-ориентированных задач путем выполнения практических работ. Позволяет сформировать умение анализировать и решать типичные профессиональные задачи разной направленности.

12.3. Перечень заданий для самостоятельной работы магистрантов

Раздел 2.

1. Опишите возможные области применения ДНК-диагностики.

2. Расскажите о правилах соблюдения биологической безопасности при работе с биоматериалами – источниками нуклеиновых кислот.

3. Перечислите методы выделения ДНК из различных биологических источников.

Объясните преимущества и ограничения каждого из методов.

4. Расскажите о современных форматах ПЦР. Опишите области их применения.

5. Какие существуют способы детекции результатов ПЦР? Перечислите преимущества и недостатки каждого из них.

Раздел 3.

1. Что такое плазмиды?

2. Отличие векторов от природных плазмид.

3. Классификации плазмид.

4. Классификации векторов.

5. Строение векторов.

–  –  –



Похожие работы:

«Ученые записки Таврического национального университета им. В. И. Вернадского Серия "Биология, химия". Том 25 (64). 2012. № 4. С. 255-263. УДК 548.736+546.64+54.057 СИНТЕЗ И ИССЛЕДОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОЙ И КРИСТАЛЛИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ КООРДИНАЦИОННОГО СОЕДИНЕНИЯ НИТРАТА ЛАНТАНА(III) С 4,4,10,10-ТЕТРАМЕТИЛ-1,3,7,9ТЕТ...»

«Ученые записки Таврического национального университета имени В. И. Вернадского Серия "География". Том 27 (66), № 2. 2014 г. С. 3–15. РАЗДЕЛ 1. ФИЗИЧЕСКАЯ ГЕОГРАФИЯ И ГЕОЭКОЛОГИЯ УДК 620.91:712.2...»

«For Official Use ENV/EPOC/EAP/MIN(2004)2 Organisation de Coopration et de Dveloppement Economiques Organisation for Economic Co-operation and Development _ _ Russian Or. English ENVIRONMENT DI...»

«Ворошилова Татьяна Михайловна КЛИНИКО-ЛАБОРАТОРНАЯ ОЦЕНКА ВЛИЯНИЯ БИСФОСФОНАТОВ И АНТИСЕПТИКА НА РЕЗИСТЕНТНОСТЬ ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ К КАРБАПЕНЕМАМ 14.03.10 – клиническая лабораторная диагностика 03.02.03 – микробиология Автореферат диссертации на соискание ученой степени...»

«МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "ТЮМЕНСКИЙ ГОСУД...»

«Пояснительная записка к рабочей программе по биологии для 9 класса Программа разработана на основе Федерального компонента государственного стандарта основного общего образования и Федерального базисного учебного плана, в соответствии с которым на изучение биологии в 9 классе выделено 68. (2 ч. в неделю). Она составлена в соответст...»

«ЛИСТ СОГЛАСОВАНИЯ от 19.01.2017 Рег. номер: 2883-1 (21.12.2016) Дисциплина: Водно-технические изыскания при обустройстве нефте-газовых комплексов 05.04.06 Экология и природопользование: Геоэкологические основы усто...»

«Институт законодательства и сравнительного правоведения при Правительстве Российской Федерации ЗАКОНОДАТЕЛЬСТВО О РЫБОЛОВСТВЕ И СОХРАНЕНИИ ВОДНЫХ БИОЛОГИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ В ВОПРОСАХ И...»

«Вестник Тюменского государственного университета. 20 Экология и природопользование. 2016. Т. 2. № 4. С. 20–32 Павел Евгеньевич КАРГАШИН1 Платон Сергеевич ЯСЕВ2 УДК 528.87+528.94 КАРТОГРАФИРОВАНИЕ ПР...»








 
2017 www.kn.lib-i.ru - «Бесплатная электронная библиотека - различные ресурсы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.